أنشئت عمادة الدراسات العليا بالجامعة عام 1992م مبتدئة بالدراسات الإفريقية، ثم تطورت وفق قرار المجلس العلمي رقم (82/1995) لتشمل أغلب التخصصات بهدف إتاحة الفرص لنيل درجة الدكتوراه والماجستير والدبلوم فوق الجامعي، وهي جهة تنسيقية تعمل بالتعاون مع كليات الجامعة ومراكزها المختلفة ــ على إدارة ومتابعة وتنسيق العمل بالدراسات العليا والكليات المختلفة والمراكز والمعاهد في الجامعة. وهي الجهة الفنية الأكاديمية التي تقوم بعمليتي التدريس والإشراف الأكاديمي على الطلاب، بينما تقوم عمادة الدراسات العليا بتنظيم تسجيل الطلاب، و الموافقة على تعيين المشرفين ، وتسلُّم رسوم الدراسة. وهي الجهة التي تصل إليها التقارير الأكاديمية عن الطلاب ،وتقوم بتقويمها ومتابعة تقدم الطلاب، ثم هي التي توصي بمنح الشهادات في نهاية الأمر.